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華大智造基因測序儀助力發現國內首例境外變種新冠毒株

http://www.zplg.net    2021年01月07日 00:02     來源:中新網廣東
圖為中國疾控中心使用MGISEQ-200的測序數據進行生信分析。華大智造 供圖
圖為中國疾控中心使用MGISEQ-200的測序數據進行生信分析。華大智造 供圖

  中新網廣東新聞1月6日電 (鄭小紅 朱族英)記者5日從華大智造獲悉,中國疾控中心近日在《中國疾病預防控制中心周報》(下稱《周報》)中稱,通過檢測發現國內首例境外變種新冠毒株。據披露,中國疾控中心對該新冠肺炎感染患者的核酸樣本以多重PCR方案建庫,并使用華大智造高通量測序平臺MGISEQ-200對病毒核酸文庫進行深度測序。

  根據近日多方披露的研究數據,從境外開始流行的這種新病毒株的傳播能力預計比普通病毒株至少要高出50%。盡管目前尚無證據表明這種新的病毒株更加致命或者會引起更嚴重的疾病,但其仍被認為是對中國預控新冠疫情構成巨大的潛在威脅。

圖為《中國疾控中心周報》發表的文章。華大智造 供圖
圖為《中國疾控中心周報》發表的文章。華大智造 供圖

  通過對MGISEQ-200的測序數據進行生信分析,研究人員發現,該毒株與11月份監測到的毒株不同,顯示32個核苷酸變異位點,通過進一步對比發現,該患者感染的毒株基因序列中包含了10月下旬開始在境外流行的VUI202012/01新病毒株中所有的28個變異點位,其中包括刺突蛋白中的3個氨基酸缺失和7個氨基酸突變。

  華大智造相關負責人介紹,MGISEQ-200是一款小巧靈活且性能強勁的高通量測序儀,以其高深度、高精度的特性,可以對病原全基因組序列進行深度測序,找到病毒突變位點,辨明病毒身份,從而找到病毒來源。目前,MGISEQ-200已入駐全球多個國家海關實驗室、疾病預防控制中心,為病毒研究、監測病毒變異提供支持。(完)



[編輯:方偉彬]

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